安捷倫氣質(zhì)聯(lián)用儀GCMS的優(yōu)點：

　　對一些特殊的化合物進行檢測,氣相色譜儀的選擇性檢測器有其特別的功能。不受復(fù)雜基質(zhì)的干擾，但難以用同一檢測器同時檢測多類不同的化合物，而不受基質(zhì)的干擾。而采用色質(zhì)聯(lián)用中的提取離子色譜、選擇離子檢測等技術(shù)可降低化學(xué)噪聲的影響，分離出總離子圖上尚未分離的色譜峰。在色質(zhì)聯(lián)用技術(shù)中，高分辨質(zhì)譜的聯(lián)用儀檢測準(zhǔn)確質(zhì)量數(shù)、串聯(lián)質(zhì)譜(時間串聯(lián)或空間串聯(lián))的選擇反應(yīng)檢測或選擇離子子離子檢測等均能在一定程度上降低化學(xué)噪音，提高信噪比。

　　1 GC作為進樣系統(tǒng)，將待測樣品分離后直接導(dǎo)入質(zhì)譜進行檢測，即滿足了質(zhì)譜分析對樣品單一性的要求，又省去樣品制備、轉(zhuǎn)移的繁瑣過程，不僅避免了樣品受污染，對質(zhì)譜進樣量還能有效控制，也減少了質(zhì)譜儀的污染，極大地提高了對混合物分離、定性定量效率。

　　2 定性能力高。用色譜保留時間結(jié)合化合物的指紋質(zhì)譜圖鑒定組分，大大優(yōu)于僅靠色譜保留時間。質(zhì)譜作為檢測器，檢測的是離子質(zhì)量，獲得化合物質(zhì)譜圖，解決了氣相色譜儀定性的局限性，由于不同化合物的質(zhì)譜圖不一樣，因此質(zhì)譜即是一種通用型檢測器，又是有選擇性的檢測器，可以說GC-MS全掃描方式是通用的、靈敏度*的色譜檢測，而選擇離子和二級質(zhì)譜掃描方式是可變的，更具選擇性的，高靈敏度的色譜柱選擇性檢測，所以應(yīng)用時優(yōu)于其他色譜檢測器，常常被作為終確證方法。

　　3 可分離尚未分離的色譜峰。用提取離子、選擇離子監(jiān)測或選擇反應(yīng)監(jiān)測法，以及結(jié)合某些數(shù)據(jù)處理方法，可分離總離子流色譜圖上尚未分離或被化學(xué)噪聲所掩蓋的色譜峰。

　　4 可提高定量分析精度。通過同位素稀釋和內(nèi)標(biāo)技術(shù)可提高定量精度和定性能力。

　　安捷倫氣質(zhì)聯(lián)用儀GCMS的缺點：

　　GC-MS氣質(zhì)聯(lián)用儀的不足在于：分析對象限于在300℃左右及以下可以汽化、并且能離子化的樣品;在加熱過程中易分解的、極性太強的化合物，如有機酸類等，則需要進行酯化衍生處理才可進行GC-MS分析，如果樣品不能汽化也不能酯化則需采取LC-MS或其他方法分析;GC-MS分析樣品應(yīng)是有機溶液，或采用熱裂解、頂空進樣技術(shù)。另外，目前質(zhì)譜還有個一個很重要的不足是對很多異構(gòu)體(尤其是位置異構(gòu))無法分辨。